|
課程名稱 |
基因體統計方法導論
Statistical Analysis for Genomic Data |
|
開課學期 |
100-2 |
|
授課對象 |
學程 生物統計學程 |
|
授課教師 |
高振宏 |
|
課號 |
Agron5049 |
|
課程識別碼 |
621 U6380 |
|
班次 |
|
|
學分 |
3 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
選修 |
|
上課時間 |
星期五5,6,7(12:20~15:10) |
|
上課地點 |
農藝304 |
|
備註 |
總人數上限：20人 |
|
|
|
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
遺傳(基因體)資料呈現的型式有許多種， 如孟德爾觀察的豌豆外表型、 ABO血型、 對偶同功? (allozyme) 、蛋白質序列 (protein sequence), RFLP (restriction fragment length polymorphism)、 RAPD (random amplified polymorphisc DNA)、VNTR (variable number of tandem repeats)、 STR (short tandem repeats)、 DNA sequence data以及微陣列 (microarray)等。 本課程主要介紹分析這些遺傳(基因體)資料的一些統計方法，用以萃取其中之訊息，來回答有關生命科學、數量遺傳學或族群遺傳學上的相關問題。 |
|
課程目標 |
(1)Nature of Discrete Genetic data
(2)Estimating Frequencies
(3)Disequilibrium
(4)Diversity
(5)Population Structure
(6)Linkage
(7)Individual Identification
(8)Outcrossing and Selection
(9)Phylogeny Reconstruction
(10)QTL mapping I
(11)QTL mapping II
(12)QTL mapping III
(13)QTL mapping IV
|
|
課程要求 |
Homework (30%), Written report (30%), Final exam (40%)
|
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
|
|
指定閱讀 |
|
|
參考書目 |
教科書:
(1) Genetic Data Analysis II by Bruce S. Weir
參考書:
(1) Introduction to quantitative genetics.
(1996). Falconer and Mackay.
(2) Genetics and analysis of quantitative traits. Lynch and Walsh.
|
|
評量方式
(僅供參考) |
|
|